По итогам 2020 года, когда действовали длительные пандемические ограничения, расходы футбольного клуба «Балтика» на выплату зарплат не сократились, а выросли на 2% по сравнению с пандемическим 2019 годом, достигнув 193,3 млн руб. Соответствующие данные бухгалтерской отчетности загружены в информационную систему https://focus.kontur.ru/.
По итогам года «Балтика» зафиксировала чистую прибыль в размере 77 млн руб. Во многом это обусловлено рекордными поступлениями на счета «Балтики», которые в основном складываются из бюджетных денег и финансовой помощи Янтарного комбината, которая проводится как рекламные контракты, при сокращении некоторых управленческих и прочих расходов.
В апреле 2020 года пресс-служба футбольного клуба сообщала, что футболистам «Балтики» снижают зарплату на 20% в связи с приостановкой спортивного сезона.